羽田空港から… 乗継便:羽田ー那覇 約2時間30分→那覇ー宮古島 約50分 直行便:羽田ー宮古島 約3時間
伊丹空港から… 乗継便:伊丹ー那覇 約1時間45分→那覇ー宮古島 約50分 直行便:伊丹ー宮古島 約2時間20分